17 条线路连接一座东西狭长的城市
深圳现有 17 条地铁运营线路、432 座车站。城市沿珠江口和南海海岸向东西展开，线网一端深入宝安、光明和机场片区，另一端延伸至龙岗、坪山、盐田海岸；福田、罗湖、南山和前海之间则分布多条平行走廊。旅行者通常不需要记住全部线路，先确定目的地位于西部、中心区还是东部，再选择进入该片区的主干线，会比只看直线距离更准确。
线路颜色和编号用来识别换乘关系，站台上的列车终点决定乘坐方向。岗厦北、福田、车公庙、后海、世界之窗、前海湾和布吉等大型换乘站可能包含较长通道和楼层转换。到达目的站后，出口编号决定从街道哪一侧开始最后一段步行。
官方图中还标出城际铁路、有轨电车和坪山云巴，它们与普通地铁使用不同图例，换乘时可能需要经过独立站厅和票务系统。首末班、临时延时和新线信息应在出发当天查看深圳地铁官网、应用或车站屏幕。
1、2/8、11 号线构成主要旅行走廊
1 号线从罗湖向西贯穿国贸、老街、大剧院、华强路、会展中心、购物公园、车公庙、华侨城、世界之窗、南山和前海湾，再进入宝安中心区。它把罗湖老城、福田商业区、华侨城景点群与南山串在同一条东西轴线上。
2/8 号线从蛇口港、海上世界出发，经后海、世界之窗、福田、市民中心、岗厦北、华强北和大剧院，继续穿过莲塘口岸、梧桐山南、盐田与大梅沙、小梅沙。前往大梅沙时无需在编号变化处换车，但仍应确认列车终点。
11 号线承担机场与中心区之间的快速联系，从机场站经前海湾、南山、后海、车公庙、福田到岗厦北及红岭南。住宿位于前海、南山科技园、深圳湾或福田时，它通常是机场 T3 进城的主轴；换乘其他线路后可继续分散到各片区。
景点相关的重要线路与站点
老街和东门片区可使用 1、3 号线老街站；3 号线继续经过翠竹、布吉和大芬，其中大芬站连接大芬油画村所在片区。10 号线从福田口岸经岗厦北、坂田和甘坑向平湖延伸，甘坑站可用于前往甘坑古镇周边。
深圳湾的滨海公共空间分布在不同车站。9 号线深圳湾公园站直接靠近滨海公园，13 号线人才公园站和后海站服务深圳人才公园及深圳湾文化广场周边；后海还是 2、11、13 号线换乘点。目的地写作“深圳湾”时，应继续确认是深圳湾公园、人才公园、后海还是深圳湾口岸。
12 号线沿南山和宝安西部运行，串联海上世界、南油、南山、桃园、南头古城、灵芝、机场东和深圳国际会展中心一带。南头古城站直接服务古城片区，海上世界站可与 2 号线换乘。
机场与铁路枢纽
前往深圳宝安国际机场 T3，应乘 11 号线到“机场站”。“机场北站”连接其他机场片区，“机场东站”位于更东侧，两者都不是 T3 的标准下车站。11 号线向东贯穿前海、南山、后海、车公庙、福田和岗厦北。
深圳北站连接 4、5、6 号线，福田站连接 2、3、11 号线。国铁深圳站使用 1 号线“罗湖站”，深圳东站使用 3、5、14 号线“布吉站”，深圳坪山站连接 16 号线，光明城站可由 6 号线支线到达。铁路票面站名与地铁站名并非总是逐字一致。
14 号线从岗厦北经黄木岗、布吉和大运快速进入坪山，16 号线进一步连接坪山站与坪山、龙岗内部。13 号线则从深圳湾口岸经人才公园、后海和南山科技园北上光明城，为东部和北部出行提供更多跨区组合。
三个主要陆路口岸
罗湖口岸对应 1 号线罗湖站，福田口岸可由 4、10 号线到达，深圳湾口岸连接 13 号线。地铁负责把旅客送到口岸交通区，过境仍需适用的旅行证件，并按现场指引完成边检与海关流程。口岸开放安排可能调整，跨境当天应查看官方通知。
三个口岸连接香港的区域不同。罗湖站同时邻近国铁深圳站，适合罗湖和老城方向；福田口岸位于深圳中心区南侧，4 号线可直达会展中心、少年宫和深圳北站；深圳湾口岸服务南山西部和深圳湾片区，13 号线可从后海、人才公园及科技园方向抵达。
深圳特有的外卡拍卡与 11 号线商务车厢
自 2026 年 6 月 30 日起，深圳地铁试运行国际银行卡拍卡过闸，覆盖现有 17 条运营线路和 432 座车站，支持境外发行的 Visa、Mastercard、American Express 与 JCB。境外旅客可以寻找张贴卡组织标识的闸机，以同一张实体卡或同一设备完成进站和出站。该服务仍处于试运行阶段，现场受理标识和官方更新优先。
11 号线列车包含普通车厢和商务车厢。使用商务车厢需支付相应附加费用；持单程票、乘车码或银行卡的旅客，在商务车厢候车区还要按官方流程再次验证。只需普通车厢时按普通候车区标识排队；选择商务车厢时，保留同一乘车介质完成进站、商务验证和出站。
